- Руфус — главный герой. Самовлюблённый и эгоцентричный юноша, мечтающий любой ценой покинуть Депонию. Его отец был мэром Кувака, но потом он сбежал. Неряшливо одет. Живёт в доме своей бывшей девушки Тони.
- Гоал — молодая девушка родом с Элизиума. Упала с органонского крейсера по вине Руфуса. При падении повредился её мозговой имплантат.
- Тони — бывшая девушка Руфуса. Ненавидит его за скверный характер. Цинична. Курит сигареты.
- Вензель — знакомый Руфуса. Благодаря действиям Руфуса, обнаружил в подвале своего дома источник чистой воды.
- Гизмо — второй по влиятельности человек (после мэра) в Куваке. Его станция спасения одновременно является полицейским участком, медицинским центром и пожарной станцией.
- Бейлиф Аргус — отрицательный персонаж. Помощник таинственного предводителя органонцев Улисса.
Игра состоит из трех частей: Депония; Депония: Взрывное приключение; Прощай; Депония!